PLoS Pathog：研究揭示子宫颈微生物组在HR-HPV自然发展中的作用

人瘤病毒（HPV）传染是最常见的性传播疾病之一。然而，只有一小部分高危（HR）HPV传染重大突破为乳头状癌前病变和癌症。在这项研究者之前，我们深入调查了乳头状菌种分组（CVM）在HR-HPV自然专书之前的起到，研究者结果已离线撰写于PLoS Pathog。

研究者扩展到18-25岁的女性，常用两次住院的HR-HPV传染女性（n = 273名女性）的乳头状样品评估CVM对HR-HPV自然专书之前的前瞻性起到。比如说重视传染清洗、持续和重大突破到乳头状上皮内瘤变2级和3级（CIN2+）。常用Illumina MiSeq该平台对细霉16S V4 rRNA基因范围和真霉ITS1范围进行时扩增和测序，对CVM进行时相关联。常用QIIME2进行时OTU聚类。常用PICRUSt推估功能分组，并常用R进行时的测试。

结果，在第1访日（V1），乳酸杆霉iners的丰度与HR-HPV传染的清洗有关（线性判别分析方法（LDA）>4.0），而V1托马斯霉是HR-HPV重大突破的主要有机体圣万（LDA>4.0）。在第2访日（V2）时，菌种香农动植物的上升与CIN2+的重大突破突出相关（P = 0.027）。多数据类型之前介分析方法辨识，V1托马斯霉与CIN2+重大突破的恰巧相关是由于V2时乳头状动植物上升常因（p = 0.040）。CVM关键糖类的全多数据类型模型辨识，通过V1乳酸霉属，OR = 0.41（0.22-0.79）、V1真霉动植物，OR = 0.90（0.82-1.00）和V1结构上细胞运动途径，OR = 0.75（0.62-0.92）兼具突出的保护起到，而V2细霉动植物，OR = 1.19（1.03-1.38）则对CIN2+的重大突破兼具预测起到。

综上所述，该研究者研究者表明，在此前瞻性纵向链表之前，乳头状菌种分组的特点与HR-HPV重大突破相关。推断，托马斯霉和重大突破到CIN2+的关联实际上显然是由随后菌种动植物的提升所介导的。与HR-HPV重大突破相关的菌种分组特点显然是预防CIN2+的治疗性操作的目标。

完整引自：

Mykhaylo Usyk, Christine P Zolnik, et al., Cervicovaginal microbiome and natural history of HPV in a longitudinal study. PLoS Pathog. 2020 Mar 26;16(3):e1008376. doi: 10.1371/journal.ppat.1008376.